Yenilgisinden sonra, yenilgiyi kaldıramayan Shung Tsung, Tarkatan ordusuyla Wu Shi Akademisini kuşatması için Baraka'ya görev verir. Wu Shi Akademi de, Earthrealm'i kurtaran Lui Kang, Johnny Cage, Kung Lao ve Sonya Blade'e törenle ödül verilecektir. Tören sırasında kuşatma başlar. 4 kişilik grup akademiyi korurken Sonya Blade kaçırılır ve Shaolin öğrencilerinin bir çoğu öldürülür. Hayatta kalan Lui Kang ve Kung Lao, arkadaşlarını bulmak ve intikam almak için harekete geçerler.
13 yaş altı izleyici kitlesi aile eşliğinde izleyebilir.